1917年夏秋之季，直隶、京畿一带连降暴雨，永定河洪水泛滥，多处堤岸溃决，北至张家口．南抵黄河，西起西陵房山以西，东到山海关，几成一片泽国，有103个县19000多个村庄被淹，635万灾民流离失所，无可归依。熊希龄奉命督办京畿一带水灾、河工的善后事宜。因见灾民缺衣乏食，有的甚至将儿女遗弃或标卖，遂决定成立慈幼局，收养灾民的子女。当年就收养了男女灾童千佘人，后陆续为家人亲属领回，次年春，尚有二百余儿童无人认领，水灾督办处不得不设置一永久性机构安置这些儿童。
在大总统徐世昌支持下，熊希龄于香山静宜园开办香山慈幼院。1919年动工兴建男女校舍，1920年10月，香山慈幼院正式开院。校训为“勤、谦、俭、恕、仁、义、公、平”。董事长是赵尔巽，院长为熊希龄，评议会员有蒋梦麟、胡适、黎锦熙、李大钊，张伯苓等l5人。慈幼院地处皇家园林，风景优美，占地极广。校舍及各种教学设备多仿欧美学校，在当时国内同类学校中，确属一流。以收录孤贫儿童为主，也兼收自费儿童，以弥补生源之不足。学生来源大致有四类：①北方水灾中幸存的儿童，②京师旗汉藉儿童；③郎家胡同灾童临时教养院的儿童；④湖南旱灾来北京的儿童。以后学生陆续增加，总额达到1600余人。熊希龄事必躬亲，对院内的各项事宜了如指掌，还曾兼过小学郝和职业部的主任，有时甚至直接下班里为老师代课。他的夫人朱其慧、毛彦文，长女熊芷、女婿朱霖都参与了学校的管理和教学工作。在他卓有成效的领导下，慈幼院很快组建起一个完整的领导管理体系和一套相对完善的管理制度，并逐渐发展成有一千六七百学生，包含六个分校(1。蒙养园，下辖婴儿教保园家庭总部；2．小学部：3．中学部，下辖幼稚师范；4．职业部；5．北平工徒学校；6．大学部——为慈幼院中学部毕业后考上其他大学的孩子们解决就读等各项问题的部门)，以及二十多个工厂(场)农场及企业单位的综合体。
